Natural de Vitória da Conquista, na Bahia, Wanderson começou sua carreira pelas categorias de base do Internacional. Contudo, o zagueiro se profissionalizou pelo Francana, em 2011. Após se destacar pelo Sertãozinho, da Serie A3 do Campeonato Brasileiro, Wanderson foi contratado pelo Timão em outubro de 2013.

No entanto o jogador só foi apresentado em 2014 e nunca jogou com a camisa corintiana. Chegou a ser emprestado ao Sertãozinho pelo Timão, onde seus direitos foram adquiridos em 2012. Hoje, o zagueiro está sob contrato do Athletico Paranaense, mas foi emprestado ao Shimizu S-Pulse, do Japão.